为进一步夯实动物疫病防控科技基础理论支撑，研究所于2026年4月成立动物疫病防控基础科学研究中心（下称基础研究中心）。基础研究中心聚焦重大动物疫病与人畜共患病防控需求，通过学科交叉，开展系统前瞻性、探索性基础研究，为相关疫病高效科学防控政策及方案的制定和关键技术的研发提供前沿基础理论支撑。基础研究中心现有固定成员5人，在站博士后2人，在读博士研究生6名、硕士研究生10名。

主要开展以下三个方面研究工作：

（1）病原－宿主互作机制研究：深度挖掘调控病原入侵、转运、复制和释放等过程的共性宿主因子，系统阐明其作用机制。

（2）AI赋能药物疫苗研发：基于病毒关键靶标的发现，融合人工智能技术构建智能化药物设计与高通量筛选平台，实现抗病毒药物及疫苗的快速发现与结构优化，推动基础研究成果实现临床应用和产业落地。

（3）新型疫苗等防控技术创制：通过解析PRRSV、PRV等重要动物病原致弱及致病机理，创制新型疫苗的防控技术产品。