2008年，国家禽流感参考实验室被认定为世界动物卫生组织禽流感参考实验室（WOAH Avian Influenza Reference Laboratory）。

实验室严格履行WOAH参考实验室职责，承担中国及相关成员国禽流感流行病学监测、分析评估、诊断技术与疫苗研发、疫情确诊、防控建议提出、信息交流和国际技术援助等工作。

实验室积极参与WOAH相关的国际及国内事务，开展国际交流与合作，充分发挥了WOAH参考实验室的积极作用，自主研发更新防控疫苗及诊断技术，研制的禽流感疫苗在中国及越南、印度尼西亚、埃及等“一带一路”国家应用超3000亿羽份，提高了我国在禽流感防控研究方面的国际地位和影响力，为全球禽流感防控提供了监测、研究平台与技术保障。